2000  年：学院顾问委员会成立，朱鎔基教授担任名誉主席；

  学院获得"工商管理"博士授予权；

2001年： 朱鎔基教授辞去院长职务，由赵纯均教授接任院长；

   管理科学与工程、技术经济及管理、数量经济学三个学 科被评为国家重点学科；

2002年： 成为国家首批正式开展高级管理人员工商管理硕士（EMBA）学位教育的学校之一；

       现代管理研究中心被批准为国家普通高等院校人文社科重点研究基地；
       由伍舜德先生捐资的清华大学高级企业管理人员培训中心教学大楼--舜德楼落成；

       全国学科评比中，管理科学与工程学科获得全国第二名；

   2003年：建立应用经济学博士后流动站；

        全国学科评比中，工商管理学科获得全国第一名；

         获得政治经济学博士学位授予权；

    2004年：企业管理系重组为企业战略与政策系、人力资源与组织行 为系、市场营销系三个系；

         隆重举办了建院二十周年庆祝活动；

         技术创新研究中心被评为“普通高等学校人文社会科学重点研究基地”；

        “现代管理与创新研究基地”通过了国家哲学社会科学创新基地专家评估；

    2005年：《计量经济学》入选国家级精品课程；

          亚太管理学院联合会首届年会成功召开；